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西北农林科技大学在植物RNA的m6A甲进化研究中取

时间:2019-08-20 18:27来源:科技
原标题:西北农林科技大学在植物RNA的m6A甲基化修饰进化研究中取得重要进展 RNA的m6A修饰是真核生物中最丰富的RNA表观遗传修饰形式。在哺乳动物里,已有的研究表明m6A的进化与基因组

  原标题:西北农林科技大学在植物RNA的m6A甲基化修饰进化研究中取得重要进展

  RNA的m6A修饰是真核生物中最丰富的RNA表观遗传修饰形式。在哺乳动物里,已有的研究表明m6A的进化与基因组核苷酸序列的选择性限制相关。本研究假设在多倍体植物基因组中,m6A的进化与WGD事件之间存在相关性。为了验证该假设,本研究首先构建了高质量的玉米全转录组m6A修饰图谱,利用生物信息学方法鉴定了来自玉米两个亚基因组的m6A修饰峰,发现每个亚基因组都包含2200个m6A修饰的复制基因。在两个亚基因组之间,被m6A修饰的复制基因在保留率方面表现出显著的差异。m6A修饰基因的这种具有偏好性的亚基因组分流与多个基因序列特征相关,并且受亚基因组间不对称进化速率的影响。本研究还发现m6A修饰基因与转座子之间存在共进化关系,这种共进化模式通过WGD和基因串联复制来介导。此外,本研究揭示了发生复制的m6A功能因子在进化过程的保守性和分化,以及m6A修饰在玉米响应干旱胁迫中的潜在作用。

  马闯教授为论文通讯作者。苗震龑副教授为论文第一作者。博士研究生张庭、博士研究生齐玉红、已毕业硕士研究生宋捷和韩兆雪副教授参与了该项研究。相关工作得到了国家自然科学基金、陕西省自然科学基础研究计划、中组部青年千人计划、陕西省百人计划和西北农林科技大学基金的资助。

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